Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF2Q5BJF6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms