Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD12Q587J7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms