Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL12Q53G59 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms