Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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