Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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