Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NREPQ16612 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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NREPQ16612 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NREPQ16612 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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