Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F4Q16254 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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