Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF56Q15929 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZNF56Q15929 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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