Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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