Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAF1AQ15573 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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