Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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