Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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