Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF4Q15306 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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