Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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