Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB3GAP1Q15042 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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