Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAPTM4AQ15012 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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