Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SSPNQ14714 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms