Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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