Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCINQ13939 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCINQ13939 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCINQ13939 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCINQ13939 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCINQ13939 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCINQ13939 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCINQ13939 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCINQ13939 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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CCINQ13939 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CCINQ13939 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCINQ13939 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CCINQ13939 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CCINQ13939 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CCINQ13939 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CCINQ13939 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCINQ13939 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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