Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
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SHROOM2Q13796 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
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SHROOM2Q13796 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SHROOM2Q13796 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SHROOM2Q13796 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
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