Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TUBB3Q13509 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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