Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PICALMQ13492 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
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