Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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