Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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