Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms