Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SP140Q13342 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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