Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATMQ13315 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATMQ13315 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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