Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ERCC8Q13216 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ERCC8Q13216 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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