Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHAF1BQ13112 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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