Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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