Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms