Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TNP2Q05952 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms