Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNB3Q05901 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms