Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms