Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID5AQ03989 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID5AQ03989 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms