Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CENPCQ03188 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms