Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms