Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF17Q02223 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms