Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HBBP68871 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HBBP68871 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms