Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKP1P63208 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP1P63208 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKP1P63208 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms