Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RPS28P62857 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms