Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RND3P61587 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RND3P61587 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RND3P61587 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RND3P61587 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms