Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms