Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCE1P61221 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms