Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms