Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms