Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms