Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BACE1P56817 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BACE1P56817 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms