Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AQP4P55087 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AQP4P55087 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AQP4P55087 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AQP4P55087 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms