Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms